在第39届世乒赛半决赛上，她被要求输给管建华，性格倔强的何智丽，以3:0击败管建华并最终顺利夺冠，她的行为引发不满，次年便被取消参奥资格。更令观众震惊的是，复出之后的小山智丽有如神助，先后击败了奥运会首个女单冠军陈静、乔红和当时排名世界第一的邓亚萍，拿下了广岛亚运会单打冠军，并表示为日本夺得亚运会冠军比为中国拿到世界冠军还要高兴，这番言论也遭到了中国观众的集体抨击，怒骂其“汉奸”、“叛国贼”。